Christian Stähr stammt aus Norddeutschland, wo er auch ab dem 16. Lebensjahr erste Erfahrungen als Kirchenmusiker sammelte. Ab 1997 studierte er zunächst Kirchenmusik (B) und Instrumentalpädagogik an der Musikhochschule Stuttgart. Daran schloß er die Studiengänge Kirchenmusik (A) und Historische Tasteninstrumente an, die er im Oktober 2006 abschloß. Zu seinen Lehrern gehören Jon Laukvik, Bernhard Haas und Hans-Martin Corrinth (Orgel), Helmut Wolf und Ulrich Kaatz (Orchesterleitung) und Dieter Kurz (Chorleitung).

Neben seinem Studium und Konzerten in Deutschland und europäischen Ländern arbeitete Christian Stähr auch immer wieder als Pädagoge und Dozent (Deutsche SchülerAkademien; Kirchenmusikalische Fortbildungsstätte Schlüchtern). Als Kirchenmusiker im Praktikum arbeitete Christian Stähr 2004/05 an der Kilianskirche Heilbronn und an der katholischen Domsingschule/Mädchenkantorei Stuttgart.

Er war Preisträger im Internationalen Orgelwettbewerb der Hansestädte in Elburg 1999.

Im Jahr 2002 erschien mit seiner deutschen Übersetzung die zweisprachige Ausgabe der „Introduction to Organ Playing in the 17th and 18th Century Stile/Einführung in das Orgelspiel des 17. und 18. Jahrhunderts“ von John Brock (Wayne Leupold Edition, USA). Mit dieser Orgelschule wird erstmals die sog. historische Spielweise für den Anfänger-Orgelunterricht zugänglich gemacht.

Seit Mai 2006 ist Christian Stähr Kantor und Organist an der Christuskirche Dormagen. Die Arbeit der Dormagener Kantorei führt er fort; neu gründete er im August 2006 den Kinderchor an der Christuskirche und die Konzertreihe "reihe 8" ab August 2007.

Seit 2009 arbeitet er als landeskirchlicher Orgelsachverständiger in 11 Kirchenkreisen zwischen Bonn, Aachen, Düsseldorf und Wuppertal; ab 2011 ist er zusätzlich als Koordinator der Orgelsachverständigen in der Evangelischen Kirche im Rheinland tätig (siehe auch hier).